「スタンプカード設定」の「スタンプカード有効期限」とは、１スタンプをゲットしたスタンプに対する有効期限でしょうか？

『スタンプカード』の有効期限は『スタンプ台帳』の有効期限となります。

例えば1枚の台帳をスタンプ5個の設定にし、スタンプが5個貯まらずに有効期限を迎えた場合は今まで貯めた分のスタンプはなくなり、再度1個目から貯めていただく仕様となっています。